3.2A ベータ版以降の XFree86 のリリースは、 X コンソーシアムの X11R6.3 (最新版) を基にしています。
R6.3 は R6.1 の更新版で、ソースとプロトコルで R6.1 と互換性があります。 バイナリは上位互換です。 X11R6.3 では以下のような拡張が Xserver に取り込まれました: SECUTIRY、 XC-APPGROUP、 XpExtension（表示機能の拡張）、そして更新されて標準版と なった LBX などです。 また X11R6.3 は新しい標準である、RX (X Remote Execution MIME type) と proxy 管理プロトコルを含んでいます。 X11R6.3 は gzip したフォントをサポートします。
R6.1 は R6 の更新版で、ソースとプロトコルで R6 と互換性があります。 バイナリは上位互換です。X11R6.1 はいくつかの新しい Xserver 機能拡張 である DOUBLE-BUFFER, XKEYBOARD と RECORD を含んでいます。
R6.2 は何だったのでしょう？ X11R6.2 は X11R6.3 のサブセットの名称で、 プリント機能拡張と縦書きとユーザ定義の文字の Xlib への実装のみ R6.1 に追加したものです．